Un método sencillo pero a la vez efectivo para modificar la extensión de todos los archivos de tipo txt a htm que se encuentran en el directorio actual sería:

for f in *.txt; do mv ./"$f" "${f%txt}htm"; done

Algunos enlaces de interés

Changing File Extensions the Easy Way
mv-Linux Command

Una forma rápida de combinar varios pdf’s en uno solo consiste en ejecutar el siguiente comando:

gs -q --dNOPAUSE -dBATCH -sDEVICE=pdfwrite -sOutputFile=salida.pdf parte1.pdf parte2.pdf parte3.pdf ...

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